Ukládání výzkumných dat v NRP – repozitáře, licence, FAIR principy
Abstract
Prezentováno na konferenci Bibliotheca academica 2025.
Full text
Registrační číslo projektu NRP CZ.02.01.01/00/23_014/0008787 Ukládání výzkumných dat v NRP Daniel Mikšík, Masarykova univerzita Bibliotheca academica 2025 7. 11. 2025
7. listopadu 2025 Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 2 European Open Science Cloud –EOSC (CZ) –Iniciativa na podporu správy výzkumných dat napříč zeměmi a vědeckými komunitami EU –v gesci národních států –Open = FAIR –V ČR posloupnost národních konsorciálních projektů z operačního programu Jan Amos Komenský (OP JAK) –Hlavním výstupem je Národní datová infrastruktura (NDI) pro výzkumná data –Společná platforma pro sdílení, správu a přístup k datům a výpočetním zdrojům
[Open Science III] IPs EOSC-CZ (od r. 2023) – organizační a znalostní zázemí –sekretariát –https://www.eosc.cz/o-nas/sekretariat-eosc-cz –Národní metadatový adresář (NMA) –https://nma.eosc.cz –školicí centrum –https://www.eosc.cz/skoleni IPs CARDS (od r. 2023) – knihovně-informační zázemí –metadatový standard: CCMM –https://www.ccmm.cz –persistentní identifikátory (PIDs) –https://identifikatory.cz –Národní katalog repozitářů (NKR) – ve výstavbě Národní repozitářová platforma pro výzkumná data (od r. 2024) – „železo a prostředí” –hw/sw základna – úložiště (hw, Ceph, S3), servery + prostředí pro běh aplikací (Kubernetes) –repozitářové systémy –CESNET Invenio, CLARIN DSpace, ASEP/ARL –pilotní repozitáře –5 ks –služby a nástroje – AAI, DSW, licence, sběr dat z přístrojů do NRP, přenos do výpočetních prostředí, mapování potřeb vědecké komunity ad. –řízení služeb – kyberbezpečnost, UX, Service Desk –konzultace, školení – metodici repozitářových systémů Open Science II (od r. 2025) – oborově specifické repozitáře, nástroje a služby –na základě vstupů od 8 tematických pracovních skupin EOSC CZ –nové a inovované repozitáře, sw nástroje (AI, citlivá data, přenos z ELN do NRP ad.) [OS III] (od r. 2026) – „rozvoj znalostí a dovedností“ Open Science II 3 Jiné zdroje, projekty Národní repozitářová platforma IPs CARDS IPs EOSC-CZ
7. listopadu 2025 Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 4 Národní repozitářová platforma (NRP) projekt –Národní repozitářová platforma pro výzkumná data –web: www.eosc.cz/projekty/nrp –koordinátor: CESNET, z.s.p.o. –hlavní projektový manažer: Luděk Matyska –partneři (9+1) –univerzity: MU, VŠB-TUO, UK, ČVUT, UPOL –AV ČR: Heyrovského ústav, BTÚ, KNAV, SSČ –NTK (bez finančního příspěvku) –trvání: 1. 1. 2024 až 31. 12. 2028 (5 let) –rozpočet: 1,3 mld. Kč, OP JAK, výzva Open Science I (OS I)
7. listopadu 2025 NDI NRP Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 5 CESNET Invenio CLARIN DSpace ASEP/ ARL Storage (S3) / App Runtime Environment (K8s) Catch-all Repository Thematic Repositories Other Storages National Metadata Directory (NMA) National Repository Catalogue (NKR) Other Systems Other Systems Thematic/Other Repositories AAI Other Repositories
7. listopadu 2025 Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 6 Národní repozitářová platforma (NRP) aktuální stav –první dvě dodávky HW (cca 39 PB), plné zprovoznění Q1/2026 –repozitářové systémy připraveny na zřízení repozitářů „jako služby“ –popsán proces zřízení repozitáře, vytvořena uživatelská podpora – metodici –www.eosc.cz/sluzby/ukladani/repozitare-v-nrp/zalozeni-repozitare-v-nrp –zprovozněn základ autentizační a autorizační infrastruktury (AAI) NRP –je k dispozici nástroj Dataspecer pro správu metadatových profilů –připraven vzor depoziční licence –dokončují se provozní podmínky NRP
7. listopadu 2025 Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 7 Pilotní repozitáře NRP –repozitáře budují výzkumné uživatelské skupiny –používají prostředí NRP v procesu jeho výstavby –poskytují zpětnou vazbu provozovateli NRP –ověřují různé scénáře využití NRP –skupiny mají vlastní odborné zázemí, financování, plány udržitelnosti –projekt NRP poskytuje prostředky na vývoj repozitářů v prostředí NRP nebo na integraci vlastního řešení do NRP –projekt NRP nepokrývá správu dat v repozitáři (data curation)
7. listopadu 2025 Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 8 Molecular Biophysics Database (MBDB) pilotní repozitář NRP –kdo: Biotechnologický ústav AV ČR, infrastruktura MOSBRI –co: surová (raw) data získaná různými biofyzikálními metodami –produkční verze (3/2025): mbdb-data.org –dokumentace, článek o budování repozitáře –záznam: GUI, API –vývoj zahájen 2021/2022, CESNET Invenio –více technik = více metadatových modelů v jednom repozitáři –velké a složité metadatové modely –synchronizace lokálně udržovaných údajů (řízené slovníky) s externími zdroji –aktuálně probíhá –napojení na AAI NRP, přechod na novou verzi CESNET Invenio
7. listopadu 2025 Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 9 Repozitář pro herbářové sbírky pilotní repozitář NRP –kdo: Přírodovědecká fakulta UK –co: fotografie/skeny herbářových položek –zobrazují se v záznamech globálních agregačních služeb JACQ -> GBIF –pilotní provoz (2024): herbarium.biodiversity.cz –vlastní sw řešení –napojení na základní vrstvu NRP a navazující služby NDI (NMA, NKR, AAI NRP) –záznam (Puškinie ladoňkovitá): GUI, JACQ, GBIF, API –záznamy vytvářejí kurátoři herbářových sbírek –aktuálně probíhá –zprovoznění OAI-PMH, transformace metadat do CCMM
7. listopadu 2025 Bibliotheca Academica 2025: Ukládání výzkumných dat v NRP 16 Výzvy –udržitelnost –finanční – téma na úrovni evropské i národní –technologická – vyvažování „co ještě dělat jako infrastruktura“ –personální a procesní – budou mít komunity dlouhodobě prostředky pro podporu svých repozitářů (správce, kurátor, vývojáři)? –tematické repozitáře vs. RO-Crate (Research Object Crate) –NMA s přidanou hodnotou –znovupoužitelnost datových sad –optimistický pohled: metadata, provenance, paradata –skeptický pohled: nestačí to pro čistě strojové zpracování/přebírání datových sad
Partneři
Registrační číslo projektu NRP CZ.02.01.01/00/23_014/0008787 Děkuji, napište mi: [email protected]