scieee AI-readable full text Open interactive document viewer

Připojení repozitáře k OpenAIRE : manuál pro správce repozitáře : prosinec 2013

Rygelová, Pavla

Full text

Připojení repozitáře k OpenAIRE Manuál pro správce repozitáře Pavla Rygelová, Ladislav Kulhánek VŠB-TUO Prosinec 2013 2 Obsah 1 Co je to OpenAIRE a OpenAIRE+? .................................................. 3 2 Vyhledání projektů ................................................................... 7 2.1 Evidence projektů v instituci .................................................. 7 2.2 Informační systém Evropské komise CORDIS ................................ 8 2.3 Portál OpenAIRE ................................................................ 11 3 Vyhledání publikací ve Web of Science .......................................... 14 4 Kolekce OpenAIRE a metadata .................................................... 14 4.1 Metadata pro propojení s OpenAIRE ......................................... 14 5 Přizpůsobení repozitáře - technické záležitosti ................................ 18 6 Literatura - Průvodci OpenAIRE ................................................... 20 3 1 Co je to OpenAIRE a OpenAIRE+? Projekty Open Access Infrastructure for Research in Europe (OpenAIRE) a navazující 2nd-Generation Open Access Infrastructure for Research in Europe (OpenAIREPlus, OpenAIRE+), realizované v letech 2009-2012, 2012-2014 a financované Evropskou komisí, mají za cíl vybudování informační, technologické a komunikační infrastruktury usnadňující sdílení a opětovné využívání vědeckých výsledků evropského výzkumného prostoru. Informační, technologické a komunikační infrastruktury, jinak řečeno portál OpenAIRE je postaven na síti již existujících otevřených repozitářů, informačních systémů o projektech (CRIS systémech) a datových archivech pro ukládání a sdílení výzkumných dat. (viz Obrázek 1) Obrázek 1 Schéma informační, technologické a komunikační infrastruktury OpenAIRE V první fázi projekt OpenAIRE realizoval záměry Pilotního programu OA 7. rámcového programu Evropské komise (EK), zahájeného v srpnu 2008 a naplňoval Pravidla pro otevřený přístup Evropské výzkumné rady (EVR) z roku 2007. 4 Povinnost pro příjemce 7. RP Pilotní program otevřeného přístupu uložil za povinnost zpřístupnit výsledky v režimu otevřeného přístupu příjemcům grantů od EVR a ze sedmi vybraných oblastí 7. RP: Energie, Životní prostředí (včetně klimatických změn), Zdraví, Informační a komunikační technologie (Poznávací systémy, Interakce, Robotika), Výzkumné infrastruktury (e-Infrastruktury), Věda ve společnosti, Socioekonomické a humanitní vědy Zajištění otevřeného přístupu Publikované výsledky z projektů je potřeba uložit do otevřeného repozitáře (tematického, institucionálního nebo do tzv. sirotčího, který je určen pro autory bez jedné z předchozích možností). Časové zajištění otevřeného přístupu Zajištění otevřeného přístupu má proběhnout v rozmezí 6ti až 12ti měsíců od vydání publikace. Do šesti měsíců od vydání má být zajištěn otevřený přístup k publikacím z projektů podpořených EVR a v tematických oblastech energie, životní prostředí (včetně klimatických změn), zdraví, informační a komunikační technologie (Poznávací systémy, Interakce, Robotika), výzkumné infrastruktury (eInfrastruktury), věda ve společnosti 7. RP (v aktivitě „E-Infrastruktury“). Do dvanácti měsíců od vydání májí být otevřeně přístupné publikace z oblasti humanitních a společenských věd v aktivitě „Věda ve společnosti“. Propojení OpenAIRE a systému CORDIS Přes portál OpenAIRE lze vyhledávat a ukládat publikace vzniklé z projektů EK. Došlo k propojení portálu OpenAIRE a systému Evropské komise CORDIS. Propojení umožňuje jednoznačná identifikace projektů v systému CORDIS. Stejné 5 identifikační číslo projektu uvádějí autoři ve vydaných publikacích v textu oznámení o grantové podpoře, díky níž publikace vznikla. Obrázek 2 Vyhledání publikací podle ID projektu Datové archivy V druhé fázi projekt OpenAIRE+ rozšířil svou strukturu o datové archivy, čímž bylo dosaženo možnosti propojovat informace o projektech, vydaných publikacích a souvisejících výzkumných datech. Zapojení datových archivů do OpenAIRE se odehrálo především v rovině interoperability. Vznikl průvodce pro přizpůsobení datových archivů podle pravidel OpenAIRE, viz kapitola Literatura - Průvodci OpenAIRE. Repozitář ZENODO Pro účely ukládání datových setů vznikl multifunkční repozitář ZENODO umožňující samostatnou správu vlastních datových kolekcí, nastavení přístupových práv a licenčních ujednání aj. Zenodo zároveň nahradí původní sirotčí repozitář OpenAIRE a nabídne řadu uživatelsky přístupných služeb. Pokračování OpenAIRE v programu Horizont 2020 V nadcházejícím programu Horizont 2020 je chápáno zajištění otevřeného přístupu k vydaným publikacím jako hlavní zásada sdílení výsledků výzkumu podpořeného Evropskou komisí. (viz tisková zpráva Evropské komise z 21. 8. 2013 - Otevřený přístup k vědeckým publikacím). Od roku 2014 budou muset být volně k dispozici všechny vědecké články, které vznikly za finanční podpory tohoto programu: 6 články buď zpřístupní okamžitě na internetu vydavatel (tzv. zlatá cesta otevřeného přístupu) články zpřístupní samotní výzkumní pracovníci ve volně přístupném archivu nejpozději šest měsíců po zveřejnění, nebo 12 měsíců v případě článků z oblasti sociálních a humanitních věd (tzv. zelená cesta otevřeného přístupu). Počítá se, že infrastruktura OpenAIRE bude zajišťovat opěrnou informační podporu pro dosažení tohoto cíle. 7 2 Vyhledání projektů Vyhledání projektů, které byly financované Evropskou unií, přesněji v rámci sedmi oblastí 7. RP EK nebo z prostředků EVR, obnáší vyhledávání v několika různých zdrojích (v institucionálních systémech evidence projektů, v systému CORDIS, na portálu OpenAIRE apod.) a kombinaci výsledků z těchto informačních zdrojů. Podstatné je získat přehled, v jakých projektech financovaných z EU je výzkumná instituce zapojena, ať už jako hlavní řešitel (koordinátor) projektu, nebo jako partnerská organizace. Pilotní program otevřeného přístupu EK se sice vztahuje na sedm vybraných oblastí, ale následující návod na vyhledání projektů toto vymezení nezohledňuje, jednak z důvodu obtížného vyhledání takto přesně vymezené množiny projektů, jednak z důvodu malého množství projektů, které do takto definované množiny spadají. 2.1 Evidence projektů v instituci Pro získání základního přehledu o projektech financovaných z fondů EU je vhodné využít dostupných informací ze systémů evidujících řešené projekty v dané instituci. (Např. VŠB-TUO vede přehled o projektech v univerzitním systému Evidence projektů, kde lze vyhledávat projekty podle poskytovatele, typu projektu aj. hledisek). Pokud instituce podobný systém neprovozuje, lze se obrátit na pracovníka příslušného oddělení pro výzkum, které se zabývá projektovou podporou. 8 Obrázek 3 Seznam typů projektů evidovaných v univerzitním systému Evidence projektů VŠB-TUO Obrázek 4 Seznam projektů vyhledaných podle kritéria: rámcový program 2.2 Informační systém Evropské komise CORDIS Informační systém Evropské komise CORDIS zajišťuje komplexní informace o dotačních programech, projektech financovaných z fondů EK a jejich výsledcích. Poměrně jednoduše lze vyhledat počty projektů podle členských států a seznam projektů dále filtrovat podle typu a podtypu programu. 9 K vyhledání projektů podle názvu instituce je potřeba znát přesný název, pod nímž je instituce vedena v systému CORDIS. Projekty VŠB-TUO lze vyhledat pod názvem „VYSOKA SKOLA BANSKA - TECHNICKA UNIVERZITA OSTRAVA“ nebo projekty VUT v Brně lze vyhledat podle „VYSOKE UCENI TECHNICKE V BRNE“. Postup vyhledání projektů VŠB-TUO: 1. vybrat na základní liště záložku „Projects and Results“ Obrázek 5 Záložka Project and Results 2. vybrat rozšířené vyhledávání (advanced search) Obrázek 6 Rozšířené vyhledávání 3. zúžit vyhledávání pouze na projekty Obrázek 7 Omezení vyhledávání pouze na projekty 4. vyhledat projekty pomocí přesné fráze = přesný název instituce 16 Název prvku projectID Definice DCMI Dc:relation Použití info:eu-repo/grantAgreement/Funder/ FundingProgram/ProjectNumber/ Jurisdiction/ProjectName/ProjectAcronym/ Příklad <dc:relation>info:eurepo/grantAgreement/EC/FP7/12345/EU// OpenAIRE </dc:relation> Příklad v záznamu v DSpace VŠB-TUO info:eu-repo/grantAgreement/EC/FP7/218086/EU//INDECT accessRights Je povinný prvek a pro vyplnění jeho hodnoty se využívá řízeného slovníku. Název prvku accessRights Definice DCMI dc:rights Použití povinný Instrukce pro použití info:eu-repo/semantics/closedAccess info:eu-repo/semantics/embargoedAccess info:eu-repo/semantics/restrictedAccess info:eu-repo/semantics/openAccess Příklad <dc:rights> info:eu-repo/semantics/openAccess </dc:rights> V repozitáři DSpace VŠB-TUO používáme pouze tři hodnoty – openAccess pro volně dostupné dokumenty; restrictedAccess pro dokumenty, které jsou přístupné pouze pro oprávněné uživatele; closedAccess pro dokumenty přístupné pouze správci repozitáře. EmbargoEndDate Datum embarga se používá v případě, že dokument může být zpřístupněn až po uplynutí určitého časového období. Embargo nastavují obvykle vydavatelé. Obvyklá lhůta embarga je jeden rok (např. vydavatel Springer, de Gruyter), ale může být i delší. Pokud je vyplněno toto pole, pak by mělo mít pole accessRights hodnotu embargoedAccess. V repozitáři DSpace VŠB-TUO zatím používáme kombinaci restrictedAccess a embargoEndDate. Po uplynutí embarga se hodnota restrictedAccess mění na openAccess. 17 Název prvku embargoEndDate Definice DCMI dc:date Použití doporučený Příklad <dc:date>info:eu-repo/date/embargoEnd/2011-05-12 <dc:date> 18 5 Přizpůsobení repozitáře - technické záležitosti Repozitáře se s OpenAIRE propojují pomocí OAI-PMH protokolu. Repozitář vystupuje jako poskytovatel dat, OpenAIRE vystupuje jako poskytovatel služby - data v pravidelných intervalech sklízí a pomocí nich poskytuje služby. DSpace už v základu poskytuje OAI-PMH rozhraní. Ve výchozím nastavení se nachází na adrese http://adresa-repozitare.org/oai/request. OpenAIRE specifikuje požadavky na strukturu metadat. Specifikuje požadavky jak na přítomnost určitých metadatových polí (například dc.relation.projectid), tak na formát dat (například pole dc.rights.access musí nabývat hodnotu s číselníku). Z technického hlediska spočívá napojení repozitáře ve vytvoření OAI-PMH rozhraní, které poskytuje data v požadované formě. Dspace verze 3.x Dspace verze 3.x napojení na OpenAIRE oproti předchozím verzím usnadňuje. Obsahuje novou implementaci OAI-PMH, která je oproti staré implementaci velmi konfigurovatelná. Umožňuje nakonfigurovat několik OAI-PMH rozhraní pro repozitář, každé z nich může vracet jiné záznamy a v jiném formátu. Už v základu obsahuje celkem tři nakonfigurované rozhraní – standardní OAI-PMH rozhraní DSpace, OpenAIRE a DRIVER. Starší verze DSpace U starších verzí DSpace je situace komplikovanější. Základní instalace žádnou podporu pro OpenAIRE neposkytuje. Repozitář je třeba upravit. Možností, jak toho dosáhnout je více. Například pro DSpace verze 1.6.2 a 1.7.2 existuje patch, který upraví OAI-PMH do kompatibilní podoby s OpenAIRE. Další možností je implementovat vlastní OAI-PMH rozhraní. Existují Java knihovny, které mohou implementaci usnadnit. Na naší instituci jsme se rozhodli upravit standardní OAI-PMH rozhraní z Dspace tak, aby vyhovovalo OpenAIRE pravidlům. Úprava rozhraní OAI-PMH DSpace VŠB-TUO OAI-PMH v DSpace je samostatná webová aplikace. V prvním kroku vytvoříme její kopii a spustíme na samostatném kontextu, například /oai-openaire. Konfigurace aplikace je v souboru $DSPACE_HOME/config/oaicat.properties. Vytvoříme kopii tohoto souboru a umístíme do adresáře $DSPACE_HOME/openaire/. 19 V souboru WEB.xml nastavíme cestu k novému konfiguračnímu souboru. Tak máme vytvořenou druhou instanci OAI-PMH rozhraní, kterou můžeme modifikovat, aniž bychom ovlivnili standardní rozhraní. V druhém kroku vytvoříme vlastní implementaci třídy ORG.oclc.oai.server.crosswalk.Crosswalk. Bude se starat o převod interního dspace záznamu do textové podoby. Nejjednodušší je vyjít ze standardní DSpace implementace OAIDCCrosswalk. Je potřeba upravit zejména metodu createMetadata(Object), která se stará o převod do metadatového formátu. Úpravy jsou specifické pro každý repozitář, záleží, jak vypadají jeho data. OpenAIRE obsahuje webový validátor, pomocí kterého lze implementaci dobře odladit. Nakonec je potřeba zajistit, aby záznamy, které má OpenAIRE sklízet, byly v množině ec_fundedresources. Takto se má množina podle specifikace OpenAIRE rozhraní jmenovat. Dspace však tvoří jména množin podle jejich handle identifikátorů. Jedno z řešení je mapovat všechny záznamy do jedné DSpace kolekce a představit před OAI-PMH rozhraní proxy, která pomocí textové substituce „přejmenuje“ vybranou množinu. Zdroje: https://wiki.duraspace.org/display/DSDOC3x/OAI+2.0+Server http://www.slideshare.net/pedroprincipe/how-to-make-your-repositoryopenaire-compliant 20 6 Literatura - Průvodci OpenAIRE Doporučení OpenAIRE 1.1 : Doporučení OpenAIRE pro poskytovatele dat : listopad 2010 OpenAIRE Guidelines 2.0 : guidelines for content providers of the OpenAIRE information space : October 2012 Pravidla OpenAIRE pro správce datových archivů 1.0 Průvodce pro autory : jak vyhovět politikám otevřeného přístupu Evropské komise a Evropské výzkumné rady : průvodce OpenAIRE pro autory – 4/5/2011 Průvodce pro výzkumné instituce Dílo Připojení repozitáře k OpenAIRE, jejímž autorem je Pavla Rygelová a Ladislav Kulhánek, podléhá licenci Creative Commons Uveďte autora 4.0 International .