Dokumentace
Abstract
Rychlý průvodce správou výzkumných dat
Full text
DOKUMENTACE Nejlepší postup je najít vhodný repozitář pro uložení dat a následovat jeho zvolený metadatový standard! Jedním z nástrojů pro snadnou a robustní dokumentaci mohou být elektronické laboratorní deníky (ELN). Jsou to softwary, které nahrazují papírové laboratorní deníky a poskytují mnoho dalších nadstavbových funkcí. TYP DAT riziko hackerského útoku formáty mohou zastarávat dostupné open source nástroje TYP DAT ADMINISTRATIVNÍ README Transparentnost - doplňuje výsledky výzkumu o informace o datech, softwaru, protokolech zdrojích. Splnění projektových podmínek - zvyšuje reprodukovatelnost výzkumu a využití veřejných prostředků. Plánování - pomáhá zůstat v průběhu projektu dobře organizován, zaznamenávat splněné cíle a určit zodpovědnost. Předcházení rizik - prevence ztráty dat, nepředpokládané náklady, nevhodné využití Soubor README poskytuje informace o datové sadě a má pomoci k správné interpretaci dat, jak pro vás a vaše spolupracovníky v budoucnosti, tak pro ostatní uživatele vašich dat. Může to být prostý text uložený ve formátu txt. nebo md. Obsah Obecné informace o výzkumu a kontaktní informace na výzkumníka.1. Popis souboru nebo datové sady, její struktury a specifické údaje o datech nutné k interpretaci obsahu (např. popis proměnných, jednotky měření, kódy chybějících údajů apod.). 2. Stručný popis použité metody pro generování dat, případně odkazy na relevantní zdroje. 3. Informace o sdílení a formě přístupu k datům. 4. Inspirace Existuje mnoho šablon pro README soubory. Důležité je být konzistentní! Můžete začít se šablonou Cornell University. Je dobré metadata sbírat a zapisovat již v průběhu výzkumu, mnoho informací se zpětně těžko dohledává. Rozsah a obsah metadatových popisů se může velmi lišit obor od oboru. Někde bude stačit obecný metadatový standard. Nejvíce používané jsou DataCite nebo Dublic Core. Obecné doporučení pro metadatový popis výzkumných data od NTK najdete zde. Rozcestníky na oborové standardy najdete např. na Fairsharing.org nebo v Metadata Standards Directory. METADATOVÉ STANDARDY ELN Finder: https://eln-finder.ulb.tu-darmstadt.de/home POPISNÁ STRUKTURÁLNÍ datum kontrolního součtu, konverze, nutný zobrazovací hardware/software Popisují vnitřní vlastnosti zdrojů. Usnadňují vyhledávání a výběr. TECHNICKÁ Popisují technické vlastnosti. Slouží pro dekódování a znovuotevření. název, autor, obor, klíčová slova, abstrakt Popisují informace o vnitřní organizaci a strukturě objektů a jejich vazby. formát, velikost souboru, přístrojové informace, datum vytvoření ARCHVAČNÍ/OCHRANNÁ Zajišťují trvalou integritu a kontext zdroje. PRÁVNÍ METADATA Slouží pro stanovení jasných pravidel přístupu a nakládání s daty. vlastník, informace o licenci POPIS PŘÍKLADY umístění v hierarchii, sekvence Dokumentace práce s výzkumnými daty je nezbytná pro jejich znovuvyužití. Výzkumná data nejlépe zdokumentujete pomocí metadat a README souborů. Metadata jsou krátké strukturované údaje, které poskytují informace o samotných datech. README soubor má pomoci ke správné interpretaci dat. Převzato z: Varrato, F. (2023) EPFL Library Research Data Management Fastguides. Zenodo. doi: 10.5281/zenodo.7551315. Použité zdoje a citace Další informace najdete na www Otevřená věda www.vutbr.cz/vav/openscience S doplňujícími dotazy se na nás neváhejte obrátit [email protected] Dědičová, P., Sedláková, E., & Skůpa, J. (2024). Rychlý průvodce správou výzkumných dat #4: Dokumentace. Vysoké učení technické v Brně. Rychlý průvodce správou výzkumných dat #4 AUTOMATICKÉ ZÁLOHOVÁNÍ ULOŽIŠTĚ A PŘÍSTUPNOST ELN PAPÍROVÝ DENÍK SNADNÝ PŘENOS SJEDNOCENÍ ZÁZNAMŮ VÝZUKMNÉHO TÝMU INTEROPERABILTA BEZPEČNOST DLOUHODOBÉ UCHOVÁNÍ riziko ztráty CENA https://kadi4mat.lib.vutbr.cz/ ELN NA VUT Metadata manuální nebo automatická Metadata mohou být tvořena manuálně nebo automaticky. Automaticky tvořená metadata jsou například informace o přístroji přiložené k souboru apod. Metadata mohou být obsažena ve stejném souboru jako samotná data (např. obrazové formáty) nebo jsou obsažená v samostatném odděleném souboru (např. README soubor). Metadata vložená nebo doplňková Dobrá praxe pro zavedení ELN v laboratoři Určit zodpovědnou osobu za projekt/laboratoř. Vytvořit robustní, standardizované a aktuální šablony. Nastavit a dodržovat své vlastní pracovní postupy a workflow, pojmenování projektů, experimentů souborů. Zabezpečit školení pro všechny nové uživatele, specificky nastavené pro danou laboratoř/projekt. Systém pro bezpečné ukládání, organizování, popis a sdílení dat. Správou dat v Kadi4Mat aplikujete některé z FAIR principů důležitých pro dlouhodobé uchovávání dat a jejich znovuvyužití. Základní informace Základní informace k nástroji: Open Science VUT Vstup do systému pomocí VUT loginu a hesla. Uložení dat bezpečně na datovém úložišti S3 od CESNET. Technická podpora a konzultace: opensci[email protected] Návody: https://www.postlithiumstorage.org/en/datamanagement/tutorials