DIGITAL.CSIC: Servicios y herramientas digitales para datos en abierto

DIGITAL.CSIC: Servicios y herramientas digitales para datos en abierto TALLER PTI-PAIS DE DATOS EN ABIERTO EN CIENCIA DEL PATRIMONIO CON PARTICIPACIÓN DE ARCHAEOLOGY HUB 26 Y 31 DE ENERO DE 2023 ISABEL BERNAL, OFICINA TÉCNICA DE DIGITAL.CSIC (URICI). CSIC Entorno institucional Mandato CSIC de Acceso Abierto desde 1 abril 2019 •Artículos de revista, capítulos/libros, otras publicaciones (Actas de congreso..) •Depósito de metadatos no más tarde de aceptación editorial en DIGITAL.CSIC •Depósito de textos completos en acceso abierto en DIGITAL.CSIC •No impone ningún periodo máximo de embargo a los textos completos Publicaciones revisadas por pares •Depósito de metadatos de los datos de investigación en DIGITAL.CSIC no más tarde de la aceptación de publicaciones asociadas •Depósito de los ficheros de los datos de investigación en DIGITAL.CSIC •Acceso abierto a los datos tan pronto como sea posible (hay algunas excepciones) •Descripción en línea con Principios FAIR •Licencia estándar (ej. Creative Commons, Open Data Commons) Datos de investigación asociados a publicaciones Mandato y Preguntas Frecuentes Énfasis en las descripciones (metadatos): no vale una descripción genérica, sino FAIR: DOI, licencia de uso, palabras clave, metodología, información sobre origen de los datos, software asociado… Acceso abierto a los datos (ficheros) a menos que existan razones legítimas para no hacerlo El mandato no cubre los big data: datasets de grandes dimensiones (terabytes-petabytes), que suelen ser dinámicos, semiestructurados/puros La petición de depósito en DIGITAL.CSIC no impide su depósito por parte de los investigadores en otros repositorios/infraestructuras de datos No existe una aplicación corporativa que actúe de inventario de colecciones de datos de investigación producidos por investigadores CSIC: LA COLABORACIÓN DE LOS INVESTIGADORES ES FUNDAMENTAL https://zenodo.org/record/7221156#.Y86oJ4TMLt4 Datos de investigación en Horizonte Europa Gestión de datos de investigación -cumplimiento de los Principios FAIR -preparación de un plan de gestión de datos -depósito de los datos tan pronto como sea posible y de acuerdo al plan de gestión de datos en un repositorio de confianza -acceso abierto a los datos en el repositorio tan pronto como sea posible (o excepciones legítimas que deben de explicarse en el plan de gestión de datos) -licencia CC-0 o CC-BY (o equivalentes) -metadatos: datasets (descripción, fecha de depósito, autores, localización, embargo si lo hay..); mención a financiación de Horizon Europe o Euratom funding; nombre, acrónimo y número del Proyecto; licencia de uso; identificador persistente del dataset (handle, DOI), identificador persistente de los autores, y si es possible de sus organizaciones y de la beca. Si es applicable, también los identificadores persistentes de las publicaciones/otros resultados de investigación relacionados (software, algoritmos, protocolos, modelos, workflows, cuadernos de laboratorio. .) ¿Ciencias del Patrimonio? •EJE CONSERVACIÓN •EJE HISTORIA •EJE DIFUSIÓN Y VALORIZACIÓN DEL PATRIMONIO Fig. 4. Schematic representation of heritage science purposes and professional environment. Resource from: ESR ESPADON-PATRIMEX project, Fondation des sciences du patrimoine, ANR-21-ESRE-00050, France Políticas y servicios de DIGITAL.CSIC para datos de investigación http://digital.csic.es/dc/recursos.jsp SERVICIOS DE DIGITAL.CSIC Inclusión en agregador de ciencia abierta de la Comisión Europea https://explore.openaire.eu/search/dataset?pid=10.20350%2Fdigitalcsic%2F13919 Plantillas de descripción y vocabularios Formulario web para describir (metadatos) y adjuntar ficheros de datasets en la intranet de DIGITAL.CSIC Para recopilar la descripción (metadatos) de tu dataset rellena el Excel PTI PAIS Datasets: plantilla normalizada para la descripción de registros en Digital (csic.es) Descripción real de un dataset Indica qué parte de la descripción depende de autores; y qué partes del repositorio/bibliotecarios Chuletas/ avisos “Trozos” en los que se reparte la descripción . Dataset for the paper “Oujja, M., Agua, F., Sanz, M., Morales-Martín, D., García-Heras, M., Villegas M.A., Castillejo, M. 2021. Multiphoton Excitation Fluorescence Microscopy and Spectroscopic Multianalytical Approach for Characterization of Historical Glass Grisailles. Talanta 230, 122314” | DIGITAL.CSIC Vocabularios controlados para PTI PAIS Getty Art and Architecture Thesaurus Online para describir técnicas, materiales, estilos.. http://vocab.getty.edu/page/aat/300389885 https://digital.csic.es/handle/10261/260833?mode=full Para la descripción en DIGITAL.CSIC necesitamos el concepto (“laser spectroscopy) y su enlace permanente (Page Link) Vocabularios para PTI PAIS https://www.wikidata.org/wiki/Q47290759 En DIGITAL.CSIC incluimos el contexto (lugar) y su identificador permanente https://digital.csic.es/handle/10261/244749?mode=full WIKIDATA para información de contexto como lugares, personajes.. Otros posibles vocabularios controlados Ejemplo, Tesauros - Diccionarios del patrimonio cultural de España - Isparta (provincia) (mecd.es) Tesauros generales (p.e, materias) y tesauros específicos (p.e, cerámica) Tesauros - Diccionarios del patrimonio cultural de España - Portada (mecd.es) https://vocabularies.unesco.org/browser/thesaurus/es/?clang=en El fichero README contiene información adicional de interés y complementa a los metadatos A partir de este fichero se puede extraer también información útil para el formulario online de metadatos Es una guía de usuario más detallada sobre un dataset para que otros investigadores puedan interpretar, comprender y reutilizar sus datos Componentes mínimos recomendados: Título del conjunto de datos DOI del conjunto de datos Información de contacto Métodos Resumen de datos y archivos Información específica de datos Condiciones de reutilización Dataset for the paper "Martín, Alba; Giráldez, F. Javier; Montero, O.; Andrés, S. 2022. Dietary administration of Lcarnitine during the fattening period of early feed restricted lambs modifies liver transcriptomic and plasma metabolomic profiles. Animal Feed Science and Technology" | DIGITAL.CSIC Buena práctica para conjuntos de datos complejos es hacer un README genérico y además uno específico para cada carpeta con datos Limpia tus datos antes de depositarlos en DIGITAL.CSIC Traduce todos los elementos codificados (no dejes abreviaciones sin desarrollar y explicar) Estandariza la información (por ejemplo, no tengas “Carlos V“, “Carlos I de España“,— elige uno y quédate con él) Revisa la ortografía Asegúrate de que cada fila tiene un identificador único (como "Número de muestra") Proporciona una breve descripción de lo que significa cada encabezado de campo - Ejemplo: “Cesta: Subcontexto de un locus en el que se depositó el espécimen”. Prepara una hoja de cálculo separada que enumere cada nombre de imagen/variable/indicador y una breve descripción Si quieres que tus ficheros se usen Fecha de creación de datos (YYYYMMDD) •Breve descripción •Localización/coordenadas geoespaciales •Nombre/número del proyecto •Muestra •Análisis •Número de versión •Extensión (3 letras) •Nombres no excesivamente largos •Sé consistente, tanto en la denominación de los ficheros como en su ordenación dentro de carpetas http://digital.csic.es/dc/politicas/politica-datosdigital-csic.jsp#politica5 https://biblio.uottawa.ca/en/services/faculty/research-data-management/file-naming-and-organization-data Formatos de ficheros FAIR Containers: TAR, GZIP, ZIP Databases: XML, CSV, JSON Geospatial: SHP, DBF, GeoTIFF, NetCDF Video: MPEG, AVI, MXF, MKV Sounds: WAVE, AIFF, MP3, MXF, FLAC Statistics: DTA, POR, SAS, SAV Images: TIFF, JPEG 2000, PDF, PNG, GIF, BMP, SVG Tabular data: CSV, TXT Text: XML, PDF/A, HTML, JSON, TXT, RTF Web archive: WARC ¿Cómo convertir tus ficheros de un formato a otro? CONVERTIO FAIR EVA para mejorar los datos de investigación en DIGITAL.CSIC https://ardc.edu.au/ LOS PRINCIPIOS FAIR TIENEN MUCHO QUE VER CON BUENAS DESCRIPCIONES DE DATASETS Ejemplo de cómo se mide un indicador RDA específico en FAIR EVA para DIGITAL.CSIC INDICADOR RDA DEFINICIÓN Y DESCRIPCIÓN DEL INDICADOR IMPLEMENTACIÓN TÉCNICA: ¿QUÉ SE MIRA EN DIGITAL.CSIC PARA HACER EL CÁLCULO? FEEDBACK PRÁCTICO PARA EL USUARIO RDA -I3-01M Los metadatos incluyen referencias a otros metadatos. Este indicador está vinculado al siguiente principio: I3: Los (meta) datos incluyen referencias calificadas a otros (meta) datos. El indicador trata sobre la forma en que los metadatos se conectan con otros metadatos, por ejemplo, a través de enlaces a información sobre organizaciones, personas, lugares, proyectos o períodos de tiempo que están relacionados con el objeto digital que describen los metadatos. Comprueba metadatos como relación o colaborador. Comprueba ORCID y descripciones regulares de proyectos. Es una buena práctica dotar de contexto al objeto digital añadiendo los siguientes metadatos: ORCID (dc.contributor.orcid), agencias financiadoras (dc.contributor.funder), proyecto/s al que pertenece (dc.relation), otros trabajos relacionados (dc.relation.isreferencedby,dc.relat ion.isbasedon,dc.relation.ispartof... ). Las plantillas de DIGITAL.CSIC indican su uso correcto. FAIR_eva/technical_implementation.md at main · EOSC-synergy/FAIR_eva · GitHub Mide el FAIRness de tus datos y mejóralos https://digital.csic.es/handle/10261/260833 https://bit.ly/3kAeDx9 Agenda de trabajo en 2023 Alinearse a buenas prácticas consensuadas en ERIHs Recomendaciones y funcionalidades específicas para reproducibilidad de la ciencia (tratamiento de métodos, workflows, materiales…) Más desarrollos técnicos para aumentar la alineación con los Principios FAIR Logística para la sesión práctica del 31 enero Gracias [email protected]